东阳的自然资源丰富，已发现和探明的矿产有金、银、铜、铀、莹石、钾长石、花岗石等20多种。其中莹石2亿吨，钾长石1.5亿吨，花岗石1万立方米，可采储量很大。铀矿是华东地区八大铀矿之一。 

东阳市土壤类型丰富，共有红壤、黄壤、岩性土、潮土、水稻土五个土类，十个亚类，三十六个土属，八十九个土种。其中红壤土类面积最大，占土地总面积的61.2%；水稻土次之，占17.92%；黄壤土类、岩性土类、潮土类面积较小，分别占土地总面积的5.67%，3.14%和1.36%；其它包括居民点、工矿、河流、塘、溪、水库及道路面积，占10.79%。成土母质为残积、坡积物、洪积物和冲积物。土壤偏酸缺磷少钾，全市水田酸性土壤占96.85%，PH< 5 .5的强酸性土壤占23.21%，速效磷低于10ppm的水田占59.89%，速效钾在100ppm以下的水田占62.48%。

东阳市植被属亚热带常绿阔叶林带，主要种子植物134个科千余种，杉、松、梓、樟、荷、栎、楝等为常见乔木，其中香樟、榧树、鹅掌揪、檫木、银杏列为国家保护树种。