余杭区水陆空交通发达，穿境而过的两条高速铁路（沪杭高铁、杭宁高铁）及杭州地铁1号线、杭州地铁2号线两条铁路（沪杭、宣杭）、两条国道（G320、G104）、七条高速公路（沪杭高速公路、杭宁高速公路、杭徽高速公路、杭浦高速公路、申嘉沪杭、杭长高速公路、杭州绕城高速公路）、两条主要河流（东苕溪、京杭大运河）和五条省道（S101、S102、S201、S304、S205），把余杭和长江三角洲各大城市紧紧相连。余杭区公路通车里程达到了2179.262公里。余杭区等级公路通村率、硬化率达到100%。区境内有航道里程350公里，其中干线30公里，支线320公里，一个遍布余杭区镇街、干支相连、水陆联动的交通运输网络已经形成。境内设有余杭高铁站，航空港依托杭州萧山机场。